A Comissão Própria de Avaliação (CPA), vinculada à Diretoria Geral, responde pela coordenação dos processos internos de avaliação do IESAM, de sistematização e de prestação de contas solicitadas pelo INEP / MEC e pela Entidade Mantenedora, é autônoma em relação aos conselhos e demais órgãos colegiados existentes na Instituição, e tem sua composição, duração de mandato de seus membros, dinâmica de funcionamento e especificação de atribuições designadas em regulamentação própria, aprovada pelo CONSEPE.